任务机制上，科学之门关联了游戏内机械聚落认证系统。部分解谜要求玩家参与内燃机说唱大赛并回答微晶单元接入逻辑控制中枢等问题，通过三级认证后方可推进剧情。此类设计将抽象科学原理转化为交互玩法，例如磁流解阀谜题需通过六边形齿轮调整能量通路，修复机械物件并护送无人机。谜题解法具有非唯一性，但需遵循点亮全部能量核心且红色通路完整的核心规则，体现游戏对科学思维具象化的尝试。
隐藏成就方面，科学之门任务链未直接关联成就系统，但完成全流程后可解锁后续剧情线索。游戏内其他科学向解谜如残响回廊齿轮谜题，需按特定顺序旋转齿轮组，其解法与拓扑学中的路径规划存在隐性关联。玩家在推进主线任务躲得过初一，躲不过十五时，必经的机关门解密同样采用类似逻辑，需通过多次交互测试电路连通性。
从版本迭代来看，3.2版本新增的智能弃置功能允许玩家按大数据筛选遗器属性，其算法逻辑与科学之门任务倡导的数据分析思维相呼应。而预言算碑扎格列斯之手等新增收集要素，进一步强化了科学推理与剧情探索的绑定关系。游戏通过这类设计，将科学方法论转化为可操作的游玩体验，而非单纯的知识灌输。
