大师球是捕捉率100%的终极道具，建议将它留给那些最难捕捉的传说级宝可梦。游戏里最值得用大师球的目标是超梦，这只超能系神兽不仅实力强悍，而且只在通关后的华蓝洞窟最深处出现一次，错过就无法再次捕捉。闪电鸟、火焰鸟和急冻鸟这三只传说鸟宝可梦同样值得使用大师球，它们分别栖息在发电厂、恶魔之山和海神洞窟，等级高达50级且出现概率极低。
除了传统神兽，大师球也适合用来捕捉梦幻这类特殊幻兽。虽然正常游戏流程中无法遇到梦幻，但通过特定活动或特殊方式触发事件后，这只稀有的粉红色宝可梦会出现，大师球能确保万无一失。卡比兽和迷你龙这类非传说但极其罕见的宝可梦也是备选目标，尤其是卡比兽会随机挡在特定路线上，用大师球可以省去反复刷新的麻烦。
要注意大师球在整个游戏流程中通常只能通过剧情获得一个，比如击败火箭队总部后从社长那里领取。部分改版游戏可能通过隐藏任务或特殊代码额外获取，但原版火红不存在这种设定。如果提前用掉了大师球，后期遇到超梦或三神鸟时就只能依靠高级球配合状态削弱战术了，这会大幅增加捕捉难度。
狩猎区的稀有宝可梦不建议浪费大师球，因为沙狐球已经能提供较高捕捉概率。同样道理，御三家或常规路线的宝可梦也不值得使用，毕竟它们可以通过存档读档反复尝试。记住大师球是消耗性道具，使用前务必确认当前遭遇的是否为真正的心仪目标，毕竟没有后悔药可吃。
最后提醒各位训练师，遇到闪光宝可梦时若没有备用的高级球，大师球就是保住这只珍稀变异体的最后保障。虽然闪光不影响战斗力，但独特的颜色搭配和极低出现概率让它成为收藏家的终极追求。合理规划大师球的使用时机，能让你的宝可梦图鉴更加完美。
