八个道馆分布在关都地区的不同城市，每个道馆对应特定的属性挑战。第一个道馆位于尼比市，由岩石系馆主小刚镇守，玩家需击败他的小拳石和大岩蛇才能获得灰色徽章。从真新镇出发，经过常磐森林即可抵达尼比市。第二个道馆位于华蓝市，馆主小霞擅长水系宝可梦，玩家需战胜她的海星星和宝石海星以获取蓝色徽章。从尼比市向东穿过月见山即可到达华蓝市。
第三个道馆位于枯叶市，电系馆主马志士在此等候挑战，他的雷丘和皮卡丘是主要战力，获胜后获得橙色徽章。从华蓝市向南经地下通道可抵达枯叶市。第四个道馆位于彩虹市，草系馆主莉嘉使用大食花和霸王花等宝可梦，玩家需通过百货公司后方的入口进入道馆。从紫苑镇经地下通道向西行进即可到达彩虹市，途中需先解决火箭队基地事件。
第五个道馆位于金黄市，超能力系馆主娜姿拥有强力的胡地和吸盘魔偶，战胜她可获得黄金徽章。从彩虹市向西行进即可到达金黄市。第六个道馆位于浅红市，毒系馆主阿桔使用臭臭泥和双弹瓦斯等宝可梦，玩家需在狩猎地带获得冲浪技能后才能抵达这座位于东南海岸的城市。第七个道馆位于红莲岛，火系馆主夏伯镇守在此，玩家需解答谜题并战胜他的烈焰马和风速狗。从枯叶市乘船可到达红莲岛。
最后一个道馆位于常青市，地面系馆主坂木使用铁甲暴龙和尼多王等强力宝可梦。这个道馆需要玩家集齐七枚徽章后才能挑战，位置在真新镇北部的常青市。八个道馆的挑战顺序并非完全固定，但建议按照岩石、水、电、草、超能力、毒、火、地面的属性相克关系合理安排挑战路线。每个道馆的胜利都将带来新的秘传技能学习机会，这些技能对后续的地图探索至关重要。
