妙蛙种子作为初始宝可梦之一，通常只能在游戏开始时从大木博士处三选一获得。这是获取妙蛙种子的最直接方式，玩家在真新镇的研究所中选择它作为伙伴后，即可开启冒险。若未选择妙蛙种子，则无法通过常规野外捕捉获得，除非使用特定版本的改版游戏。需原版火红的设计初衷是让玩家仅能通过初始选择拥有御三家之一，其他两只无法在野外自然遇到。
对于使用改版游戏的玩家，例如火红386版本，妙蛙种子的出现位置会有所不同。这类改版通常会将御三家分布在地图的特定区域，如常磐森林或沙湖乐园附近的草丛。玩家需反复在这些区域遇敌，才有几率遇到野生的妙蛙种子。由于改版规则各异，具体位置可能因版本调整而变化，建议参考对应改版的说明文档。部分改版还会将杰尼龟和小火龙也加入野外遭遇列表，但原版火红并不支持这一机制。
若玩家希望在原版火红中获取额外的妙蛙种子，唯一合法途径是通过与其他训练家交换。这种设计鼓励玩家之间的互动，但实际操作中需依赖通信功能，且对方必须愿意交换初始宝可梦。由于交换条件较为苛刻，多数玩家会选择专注于培养已选择的御三家。游戏内不存在NPC赠送或剧情触发获取妙蛙种子的设定，任何非交换或初始选择的获取方式均涉及非官方修改。
从游戏平衡性来看，妙蛙种子的草/毒属性组合在前期道馆战中优势显著，尤其对岩石系和水系对手效果突出。其技能池包含寄生种子、催眠粉等控场招式，配合日光束等强力攻击，能有效应对多种战斗场景。尽管无法通过常规手段重复获取，但已选择的妙蛙种子可通过等级提升快速进化，最终形态妙蛙花在通关过程中表现稳定。这种设计既保留了初始宝可梦的独特性，也确保了队伍强度的合理性。
口袋妖怪火红版本对妙蛙种子的分布设计体现了经典御三家机制的核心逻辑——初始选择不可逆且具备唯一性。玩家若希望体验不同御三家的玩法，需通过多周目或交换实现。改版游戏虽提供了更多获取途径，但会偏离原版的设计意图。建议根据个人偏好选择游玩方式，并充分了解不同版本的规则差异。
