要导航到口袋妖怪火红版的三岛，首先需要完成主线剧情的前期任务。在获得第七枚徽章后，枯叶市的道馆馆主会询问是否前往七岛旅行，选择同意后即可乘船前往第一个岛屿。在第一个岛屿的实验室获取三个岛的通行证，这是进入后续岛屿的关键道具。随后在第二个岛屿接取帮助父亲寻找女儿的任务，根据线索前往第三个岛屿的森林深处击败吓到女儿的精灵，完成任务后可获得月之石奖励。
前往三岛的核心路径涉及第五和第六岛屿的密码解谜。从第五个岛屿的回忆之塔出发，坐船抵达第六岛屿后，需从右侧冲浪到遗迹山谷并穿过绿色小径。在森林尽头洞穴中使用一字斩开门，洞内迷宫需按特定顺序行走：上、左、右、下。取得蓝宝石后虽会被抢走，但能获得另一段密码。返回第五岛屿输入密码打开仓库门，击败火箭队夺回蓝宝石。
完成蓝宝石任务后需返回第一个岛屿交付宝石，会开通关都地区与七岛的通讯功能。接着前往最后一个岛屿即第七岛屿，在洞穴内推动石头至指定位置可解锁捕捉未知图腾的区域。此阶段需注意洞穴结构复杂，建议提前规划行进路线。最终回到水蓝市收服超梦，标志着三岛主线剧情的完结。
关键技能包括冲浪术（野生原野区深处获取）、一字斩（圣安奴号船长赠送）和闪光术（收服10种宝可梦后由博士助手提供）。这些技能能解决地形障碍，例如一字斩可清除挡路树木，闪光术能照亮岩山隧道。合理配置技能可显著提升探索效率。
